農業綜合開發項目是中央為改善農業發展環境和基本生產條件，從而提高農業綜合生產能力和綜合效益的一種手段。國家設立農業綜合開發項目，專門對從事農業資源綜合開發利用的企業進行資金扶持，達到保證國家糧食安全的目的。

    農業綜合開發項目主要包括土地治理項目、產業化經營項目兩個大類。土地治理主要包含基本農田及高產田高產田建設，生態治理、沙漠化治理、小流域治理以及灌區的節水灌溉改造等。產業化項目，主要指農業種植、畜牧水產養殖等種養殖項目，同時包括農產品加工、儲藏保鮮、產地批發流通設施項目。

    農業綜合開發項目要求重點突出項目的公益性、環保性、科技性、特色性：環保型，支持農產品廢棄物處理及隔離環保設施建設、農業汙染防治、廢棄物綜合利用、實施秸稈有機肥轉化、發展農業循環經濟等；公益性，主要以吸引和解決農民就業、提高農民收入水平為宗旨，通過種植加工的產業化模式，提高區域整體產業的經濟附加值，達到整體發展的目的；科技性，要求帶入新型科技元素，重點突出農業範圍內的新品種選育、農作物病蟲害防治、疫情疫病監測、提高加工效率和效益的技術設備；特色性，要求承接當地傳統特色農業優勢，發展具有明顯地方特色的產業，並通過現代農業技術挖掘傳統特色農業的潛力，達到區域特色突出、競爭優勢明顯的目的。

    農業綜合開發項目申報從最底層的農業技術服務中心（或農綜辦）開始自下而上申報，要求逐步實施，各級農發機構應依據農業發展中長期規劃和國家農業綜合開發政策，製定本地區農業綜合開發總體規劃及階段性開發方案，並在此基礎上，建立土地治理項目庫和產業化經營項目庫。項目申報需要製定開發規劃、建立項目庫、編製項目建議書、項目可行性分析報告等。

    農業綜合開發項目的資金扶持方式主要分為貸款貼息和財政補助兩種方式，目前絕大部分區域均以貸款貼息為主。